慈恩園生命紀念館全館採現代化規劃設計，外觀聳立雄偉格局莊嚴雅緻，館內建材採進口大理石、花岡岩鋪列陳設，壯觀肅然典雅。全館全年中央空調系統恆溫控制乾濕度適宜，媲美六星級高級飯店。全區共分孝親館(佛道教區)、敬親館(佛道教區)、禮親館(教友區)三大特區。

慈恩園生命紀念館為尊重各宗教信仰，特別規劃獨立專屬三大主題區，按各宗教教派文化設計有孝親館、敬親館為佛、道教獨棟專區，禮親館為教友獨棟專區。各館設施規劃依各宗教文化傳統禮俗，於各館內、各樓層中設計配置不同的宗教典故，祈以各宗教信仰者能獲得最大的心靈指引與庇佑。

山神福德廟位於園區入口處，整座建築以花崗石建造而成，主神供奉山神福德，坐鎮慈恩園，守護安奉於慈恩園的先人，庇佑後代子孫，福壽安康。

孝親館特依佛道教文化禮法，以修行主題為規劃重點。相傳先人於往生後須接受仙佛指引修行，方能歸化天界，脫離輪迴疾苦，重回天人境界。慈恩園特於孝親館規劃修行主題，從一樓大廳至十三樓藏經閣層層均以導引修行設計為主題。在一樓大廳供奉有大慈大悲阿彌陀佛、觀世音菩薩、地藏王菩薩，接引亡靈入修行境地，放下人間一切難捨罣礙，入塔後再依各塔樓層供奉不同的神佛，逐層修行受戒，最後進入第十三層藏經閣中飽閱經書待修行功德圓滿，再由三寶佛接引西方極樂世界，超脫人世間一切疾苦。

孝親館在一樓大廳法相莊嚴肅靜，中央佛堂特以重達近四十公噸花崗岩堆砌而成，意如穩如泰山，再由數萬片金箔貼砌完成以供眾靈臨近聽法修行。神壇上供奉有大慈大悲阿彌陀佛、觀世音菩薩、地藏王菩薩，兩旁立有韋馱、伽藍二大護法戒護在旁，接引亡靈進入修行境地。大廳中央上有天蓮下有地蓮，天地相應緊緊守護眾靈不受外界侵擾。

大廳右側特別懸掛有銅雕壁畫阿彌陀佛二十五尊菩薩來迎圖及阿彌陀佛西方接引圖，左側有普門品顯示觀世音菩薩卅二相說法圖及十八尊羅漢過江圖，特別引進中國銅立體彩繪浮雕畫，幅幅雕工細膩畫面生動精彩。

孝親館二樓設有現代化休憩區，座位寬敞舒適，氣氛雅靜，家屬可於參拜先人後在此稍事休憩。

三樓廳堂供奉地藏王菩薩，守護先人之靈不受侵擾，往生者隨時聽教修行，家屬亦可於此禮敬參拜先人。

3R樓規劃有專屬陽台光線明亮，廳堂供奉地藏王菩薩駕坐神獸獍，聽曉天地間各式聲音，協助凡間孤魂。廳堂左側為牌位專區，牌區前有釋迦摩尼佛說法，阿難、迦葉尊者護持在側，為安奉在此往生者說法開釋迷津。廳堂後側為塔位區，中央區臥佛畫像光照眾生，兩側特引進越南精緻神佛漆畫於旁，常伴先人。

七樓有如佛教中七層寶塔，廳堂左側備有家屬休憩區，參拜家屬可於此小憩片刻，廳堂後側為塔位區，塔區中兩側特引進越南精緻飛天仙女漆畫於旁，塔區內每一塔位均為進口防火、耐蝕之高級建材建製而成，安全指數超高。

九樓御璽塔位，是全區最寬敞，設施最完善之區，慈恩園特挑選本棟九樓為御璽之區，因為易經之中，九為至極之數，亦為至尊之義，在古代更為帝王代表之數。

御璽塔位之龕位規劃，依循古代將相王侯之規格設計，細膩精緻，各項配置深具意義，尊貴非凡，氣勢昂人，更遵從佛教之各項教義禮法，整體規劃，處處可見，別具用心，更使本區尊榮不凡。從九樓進入御璽塔位大廳，即見法相莊嚴面容慈悲地藏王菩薩駕坐騎善聽，寬容渡引過往一切因由過失，赦免解脫過往所有業障，免墮責難之殿。

十樓規劃為VIP專區，本區特別從緬甸、越南引進高級紅花梨木裝置而成，每一片花梨木均以手工立體浮雕雕工精緻，木香環繞環境典雅肅然。大廳堂供有娑婆三聖為往生者說法開釋，廳堂後為塔位區。塔位區內中央供有阿彌陀佛立於池央，四面普照引渡眾生，右有觀世音菩薩四面普照指引光明，左有地藏王菩薩四面普照守護亡靈。

塔區內每一塔位門板上均鑲有天然寶石，安奉於此尊容無上，可吸納天地精華福延子孫。本區備有專人塔位及夫妻塔位，慈恩園在每一牌位特別設計專屬屋簷及繪有法像之保護層，家屬可隨時打開塔位門瞻仰先人，宛如每一位先人均在神佛的保護庇蔭中，讓先人居住於此更佳安心。本區特闢現代化網路瞻仰專區，家屬可透過電腦追思先人。

十三樓藏經閣，為最高修行道場乃有近天之意。閣中寶藏經書為往生者提供行最高境界，為通往西方極樂世界必經之處。先靈於逐層修行至此飽閱群經，功滿超脫。藏經閣中特供奉三寶佛尊，具數百年之久歷史，飽受數百年間各修行法師誦讚禮拜，法力無邊，在此為先靈指點行津，待先靈功德圓滿超渡接引至西方極樂世界。

未來慈恩園將繼續開闢敬親館為佛道教專區，全館按佛道教禮法規劃，地上建築樓高13層，地下1層，共計14層。層層因各種不同需求精心規劃，匠心獨到，意義非凡。

慈恩園於敬親館特別規劃有法會區，設有六星級守靈區，場地寬敞可同時容納數組法事同時進行，免除場地不足之苦。家屬可於此處進行誦經、守靈、百日、對年法會，並附有簡易休憩區提供家屬稍事休息。

3樓規劃富貴塔位,全區圖騰浮立細膩精緻，四周燈光明亮走道寬敞，塔位備有東、西、南、北各方為坐向，可依個人生辰選擇合適方位，安奉於此富貴襲蔭世代子孫。

每一座塔位門板，特以佛教相關法寶依法設計，在門板中雕有供桌及供品意如長年燭火、鮮花、香煙親人如侍在旁，時時刻刻清香敬奉；蓮花-聖潔智慧，不染俗塵；華蓋-佛法無疆，遍覆三千；法輪-佛法圓融，法輪常轉；法螺-佛音遠傳，妙音吉祥……，祈使每一位先人時時刻刻受到法寶的庇護與仙佛引導。

禮親館教友專區，地上建築樓高13層，地下1層，共計14層，全棟採日本進口白色矽酸鈣板建材防火耐震。 一樓大廳設有如教堂般肅靜的禮拜堂，大廳右側設有國家音樂廳級管風琴，地板採花崗石鋪設而成，場地寬廣莊嚴可同時容納數十人舉行告別追思儀式。

慈恩園為對教友表示尊重不惜斥資百餘萬元，於大廳中設有象徵聖潔十字架，右側設有國家音樂廳等級管風琴，音質雄偉氣勢磅礡猶如身於歐洲教堂，在此舉辨追思告別，場景肅穆感人。於禮親館三樓為基督教獨層專屬塔位區，設有小型追思廳，全廳以檜木及花梨木建構而成，肅穆雅緻適合家屬聚會追念先人。

慈恩園特別於禮親館3R樓設立教友專區，並於5樓規劃VIP典藏塔位區，全區潔淨明亮，氣氛莊嚴溫馨，塔區配有歐洲百年教堂壁畫，中央設有尊貴祭壇，更增添塔區聖潔無染。典藏塔位面版中十字架，以數十顆鑽石鑲崁而成，代表無染的純潔，象徵天使的鴿子將先人擁護其中前行引導，接受上帝的恩澤。